C.V.

DOCTORAT

Diplôme de doctorat: Analyse de Génomes et Modélisation Moléculaire

Université : Denis Diderot Paris VII - 2 place Jussieu 75251 Paris Cedex 05 FRANCE

Responsable : Pr. Catherine Etchebest (e-mail : Catherine.Etchebest@ebgm.jussieu.fr, formerly Pr. S. Hazout)

Sujet : HCVDB : une base de données de séquences du virus de l'hépatite C interconnectée au Webiciel NPS@ d'outils bioinformatiques d'analyses de séquences et de structures

Directeur de thèse : Pr. Gilbert Deléage (e-mail : g.deleage@ibcp.fr)

Laboratoire : Institut de Biologie et Chimie des Protéines (IBCP) - Pôle BioInformatique Lyonnais (PBIL)

Date : 1er juin 1999 au 31 mai 2001

FORMATION

Année	Diplôme	Etablissement	Session	Mention
2001	Doctorat Analyse de Génome et Modélistaion Moléculaire	U.D.D. (1)	5 juin 2001	Très honorable avec les félicitations du jury
1997	D.E.A. Analyse de Génome et Modélistaion Moléculaire^*	U.D.D. (1)	Juin	Bien
1995	Maîtrise de Biochimie	U.C.B.L (2)	Septembre	Passable (239/400 pts)
1994	Licence de Biochimie	U.C.B.L (2)	Septembre	Assez bien
1992	D.E.U.G Sciences de la Nature et de la Vie	U.J.M.S.E (3)	Septembre	Assez bien

(1) Université Denis Diderot Paris 7

(2) Université Claude Bernard Lyon 1

(3) Université Jean Monnet Saint Etienne

* Stage du 20 janvier au 30 juin 1997, modélisation moléculaire de la glycoprotéine gp41 du virus de l'immunodéficience humaine. Institut de Biologie et Chimie des Protéines. Directeur : Pr Gilbert Deléage.

EXPERIENCE

Bioinformatique :

Depuis le 1 octobre 2002: chargé de recherche CNRS (IBCP).
Du 1 septembre 2001 au 30 septembre 2002, Stage post-doctoral dans l'équipe du Dr N. Guex (GSK).
Du 4 au 8 décembre 2000, participation au SRS administrator workshop, LION Bioscience, Cambridge (UK).
Du 4 avril 1998 au 30 avril 1999, développement du serveur Web d'analyses de séquences protéiques NPS@ (URL: http://npsa-pbil.ibcp.fr/).

Institut de Biologie et Chimie des Protéines - Pôle Bio-Informatique Lyonnais. Directeur : Pr. G. Deléage.
Du 22 septembre 1997 au 31 décembre 1997, mise au point d'un screening virtuel de molécules thérapeutiques en utilisant des techniques de docking protéiniques.

Centre de Recherche et de Développement Lacassagne du groupe LIPHA - 115, av. Lacassagne 69003 Lyon - Directeur: Jacques BARBANTON, responsable du service modélisation moléculaire.

Enseignements et formations dispensés :

Formation Fc3Bio 2007.
Cours + TD au CUST de 2002 à 2007.
Travaux dirigés de Bioinformatique de la 1^ère année du magistère de Biologie Moléculaire et Cellulaire de l'Ecole Normale Supérieure de Lyon en 1997 et 1998.
Participation à la formation à l'analyse de séquence et à la modélisation moléculaire de protéines de l'unité de modélisation moléculaire LIPHA (29 mars - 1 avril 1999 et 9 avril 1999).

COMPETENCES

Bioinformatique :
- Analyse de séquences et modélisation moléculaire
- Interrogation des banques de données internationales et des sites de bioinformatique sur le réseau Internet
- Logiciels scientifiques: AnTheProt, Sybyl, MPSA, NPS@, RASMOL, SRS, SWISS-PDB VIEWER, VMD, XPLOR et CNS
Informatique :
- Système d'exploitation: MacOS X et UNIX/LINUX
- Programmation: C (make), HTML, SQL (PostgreSQL), PERL5 (PERL DBI, CGI, LWP) et Java (JDBC, SWING, Ant)
- Web: HTML/XHTML, XML, CSS, JSP, programmation CGI et servlet
- Administrateur Apache, PBS, PostgreSQL et Tomcat
- Bureautique: Microsoft Office
Anglais scientifique.